Muso Gonnosuke, o fundador do Shindo Muso Ryu, tornou-se Instrutor do clã Kuroda, uma importante casa Samurai.
Foi lá que o Shindo Muso Ryu ficou preservado até o fim da época dos Samurais. Dentro do clã, outros estilos também eram ensinados e, com o tempo foram assimilados pelo Shindo Muso Ryu. São chamados Fuzoku Ryuha, ou estilos associados.
Até hoje, estes estilos são ensinados junto com o Shindo Muso Ryu. São preservadas técnicas de armas exóticas, como a Kusarigama e o Jitte, e também algumas das mais antigas técnicas de Kenjutsu. O Shindo Muso Ryu tornou-se, assim, uma das mais ricas tradições que chegaram a nossos dias.